Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAPPC2LQ9UL33 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms