Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
AMFRQ9UKV5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMFRQ9UKV5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms