Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBE1Q9UJT0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBE1Q9UJT0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms