Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms