Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFMBT1Q9UHJ3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFMBT1Q9UHJ3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms