Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NPC1L1Q9UHC9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPC1L1Q9UHC9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms