Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VTI1BQ9UEU0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms