Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPS7AQ9UBW8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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