Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLKQ9UBT6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
POLKQ9UBT6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms