Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVK-18Q9QC07 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms