Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RRBP1Q9P2E9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RRBP1Q9P2E9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms