Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC39.64■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
CCDC180Q9P1Z9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC39.63■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC39.6■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC39.6■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC39.59■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC39.59■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
CCDC180Q9P1Z9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.57■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CCDC180Q9P1Z9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms