Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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RDH8Q9NYR8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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RDH8Q9NYR8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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