Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL28Q9NXS3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL28Q9NXS3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms