Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHBDL2Q9NX52 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDL2Q9NX52 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms