Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG3Q9NT62 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG3Q9NT62 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms