Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPRMQ9NS64 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms