Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 AGPAT3-211ENST00000467358 3955 ntTSL 215.24■□□□□ 0.035e-6■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 PPP2R5C-209ENST00000553890 492 ntTSL 317.45■□□□□ 0.381e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 PPP2R5C-213ENST00000554504 448 ntTSL 38.98□□□□□ -0.971e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 MBOAT7-214ENST00000495968 465 ntTSL 540.91■■■■■ 4.149e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.069e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 DVL1-207ENST00000633096 580 ntTSL 436.31■■■■□ 3.49e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 DVL1-208ENST00000634054 828 ntTSL 533.7■■■□□ 2.989e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 YARS-207ENST00000481895 1018 ntTSL 530.77■■■□□ 2.529e-33■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.479e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 KIF2A-207ENST00000509663 759 ntTSL 329.86■■■□□ 2.379e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 MBOAT7-210ENST00000474910 629 ntTSL 229.81■■■□□ 2.369e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 AKT2-208ENST00000416994 904 ntTSL 428.57■■■□□ 2.169e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 AKT2-228ENST00000537834 1402 ntTSL 227.89■■■□□ 2.069e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.559e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.439e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 GSE1-209ENST00000479488 649 ntTSL 223.52■■□□□ 1.369e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.249e-33■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 AKT2-227ENST00000498350 562 ntTSL 422.71■■□□□ 1.239e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 DVL1-205ENST00000631679 778 ntTSL 517.73■□□□□ 0.439e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 TET3-203ENST00000475405 1608 ntTSL 1 (best)16.28■□□□□ 0.29e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 KIF2A-201ENST00000381103 3360 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.049e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 YARS-210ENST00000616261 1167 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.179e-33■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 KIF2A-204ENST00000504883 783 ntTSL 213.97□□□□□ -0.179e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 KIF2A-210ENST00000514082 874 ntTSL 1 (best)10.63□□□□□ -0.719e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.149e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.664e-7■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.774e-7■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 DNAAF5-203ENST00000437419 585 ntTSL 531■■■□□ 2.552e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 DNAAF5-204ENST00000438961 579 ntTSL 430.19■■■□□ 2.422e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 DNAAF5-205ENST00000440747 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 222.62■■□□□ 1.212e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.942e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.142e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.174e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.124e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.124e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 OGFOD2-213ENST00000540324 1828 ntTSL 1 (best)27.73■■■□□ 2.034e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.964e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.434e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.094e-8■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 RSF1-202ENST00000440064 604 ntTSL 531.92■■■□□ 2.74e-10■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 RSF1-208ENST00000530604 520 ntTSL 227.6■■■□□ 2.014e-10■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 RSF1-206ENST00000528095 2107 ntTSL 1 (best)27.03■■□□□ 1.924e-10■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 RSF1-203ENST00000467567 2982 ntTSL 220.73■□□□□ 0.914e-10■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.014e-10■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 14e-16■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 TMBIM6-222ENST00000550445 761 ntTSL 319.26■□□□□ 0.674e-16■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 TMBIM6-225ENST00000552370 882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.234e-16■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 TMBIM6-216ENST00000549130 446 ntTSL 513.26□□□□□ -0.294e-16■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.84e-16■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 ULK1-205ENST00000541761 1262 ntTSL 223.95■■□□□ 1.424e-7■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.342e-6■■■□□ 15.8
DROSHAQ9NRR4 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.511e-8■■■□□ 15.7
DROSHAQ9NRR4 FAAP20-207ENST00000420515 1544 ntTSL 1 (best)41.54■■■■■ 4.244e-6■■■□□ 15.7
DROSHAQ9NRR4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.023e-7■■■□□ 15.7
DROSHAQ9NRR4 PCBP2-222ENST00000552296 1342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.118e-30■■■□□ 15.7
DROSHAQ9NRR4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.521e-6■■■□□ 15.7
DROSHAQ9NRR4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.951e-6■■■□□ 15.7
DROSHAQ9NRR4 KCNN4-205ENST00000599720 983 ntTSL 526.82■■□□□ 1.881e-6■■■□□ 15.7
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP12-202ENST00000344936 4128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.023e-7■■■□□ 15.7
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP12-203ENST00000375245 4958 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.113e-7■■■□□ 15.7
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP12-205ENST00000396144 5084 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.193e-7■■■□□ 15.7
DROSHAQ9NRR4 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.553e-7■■■□□ 15.7
DROSHAQ9NRR4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.845e-6■■■□□ 15.7
DROSHAQ9NRR4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.252e-8■■■□□ 15.7
DROSHAQ9NRR4 PIP4K2B-202ENST00000617499 547 ntTSL 428.43■■■□□ 2.142e-8■■■□□ 15.7
DROSHAQ9NRR4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.596e-6■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 ARRDC1-205ENST00000466367 866 ntTSL 1 (best)33.48■■■□□ 2.956e-6■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 ARRDC1-202ENST00000419386 829 ntTSL 332.89■■■□□ 2.866e-6■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 ARRDC1-204ENST00000461627 882 ntTSL 232.29■■■□□ 2.766e-6■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 ARRDC1-207ENST00000471125 612 ntTSL 332.29■■■□□ 2.766e-6■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 ARRDC1-211ENST00000495220 747 ntTSL 231.01■■■□□ 2.556e-6■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.376e-6■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 ARRDC1-203ENST00000431925 555 ntTSL 328.42■■■□□ 2.146e-6■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 ARRDC1-209ENST00000483563 704 ntTSL 328.22■■■□□ 2.116e-6■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 ACTN4-207ENST00000495553 586 ntTSL 514.34□□□□□ -0.116e-6■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 ICAM5-202ENST00000586004 567 ntTSL 430.94■■■□□ 2.541e-8■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 ICAM5-204ENST00000587398 624 ntTSL 229.01■■■□□ 2.231e-8■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 CAPRIN2-213ENST00000542550 770 ntTSL 340.19■■■■■ 4.027e-9■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 CAPRIN2-211ENST00000540584 569 ntTSL 435.66■■■■□ 3.37e-9■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 CAPRIN2-212ENST00000541765 630 ntTSL 533.36■■■□□ 2.937e-9■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 CAPRIN2-215ENST00000546129 501 ntTSL 433.12■■■□□ 2.897e-9■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 CAPRIN2-210ENST00000540436 557 ntTSL 331.34■■■□□ 2.617e-9■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 CAPRIN2-207ENST00000537108 2187 ntTSL 512.23□□□□□ -0.457e-9■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 CAPRIN2-206ENST00000534897 478 ntTSL 42.94□□□□□ -1.947e-9■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 ABHD17A-206ENST00000592757 740 ntTSL 330.66■■■□□ 2.54e-7■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 TCF25-210ENST00000563484 468 ntTSL 217.91■□□□□ 0.461e-6■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.345e-10■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.275e-10■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 YWHAH-204ENST00000443669 822 ntTSL 335.15■■■■□ 3.225e-10■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.071e-6■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 RBM38-201ENST00000342690 852 ntTSL 333.59■■■□□ 2.971e-6■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.781e-6■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 RBM38-202ENST00000344785 2193 ntTSL 527.36■■□□□ 1.971e-6■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.493e-8■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.231e-6■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 TUBA1C-209ENST00000552448 1800 ntTSL 315.9■□□□□ 0.143e-8■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 TUBA1C-202ENST00000541364 1695 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.063e-8■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 TUBA1C-210ENST00000639419 1075 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.113e-8■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 GPX4-211ENST00000614791 431 ntTSL 336.94■■■■□ 3.55e-10■■■□□ 15.6
DROSHAQ9NRR4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.175e-10■■■□□ 15.6
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