Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO8Q9NRD0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FBXO8Q9NRD0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms