Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SEMA4BQ9NPR2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEMA4BQ9NPR2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms