Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CLSPNQ9HAW4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLSPNQ9HAW4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms