Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DCLRE1BQ9H816 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DCLRE1BQ9H816 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms