Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MED28Q9H204 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MED28Q9H204 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms