Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MTMR12Q9C0I1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MTMR12Q9C0I1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms