Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CIPCQ9C0C6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CIPCQ9C0C6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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