Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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FOXQ1Q9C009 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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FOXQ1Q9C009 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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FOXQ1Q9C009 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXQ1Q9C009 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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