Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTRT3Q9BYD9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTRT3Q9BYD9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTRT3Q9BYD9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTRT3Q9BYD9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTRT3Q9BYD9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTRT3Q9BYD9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTRT3Q9BYD9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTRT3Q9BYD9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTRT3Q9BYD9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTRT3Q9BYD9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTRT3Q9BYD9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTRT3Q9BYD9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTRT3Q9BYD9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTRT3Q9BYD9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTRT3Q9BYD9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTRT3Q9BYD9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTRT3Q9BYD9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTRT3Q9BYD9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTRT3Q9BYD9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTRT3Q9BYD9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTRT3Q9BYD9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTRT3Q9BYD9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTRT3Q9BYD9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTRT3Q9BYD9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTRT3Q9BYD9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTRT3Q9BYD9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTRT3Q9BYD9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTRT3Q9BYD9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTRT3Q9BYD9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTRT3Q9BYD9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTRT3Q9BYD9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTRT3Q9BYD9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms