Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB11FIP5Q9BXF6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms