Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRACR2AQ9BSW2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms