Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TINF2Q9BSI4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TINF2Q9BSI4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TINF2Q9BSI4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TINF2Q9BSI4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TINF2Q9BSI4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TINF2Q9BSI4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TINF2Q9BSI4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TINF2Q9BSI4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TINF2Q9BSI4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TINF2Q9BSI4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TINF2Q9BSI4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TINF2Q9BSI4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TINF2Q9BSI4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TINF2Q9BSI4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TINF2Q9BSI4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TINF2Q9BSI4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TINF2Q9BSI4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TINF2Q9BSI4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TINF2Q9BSI4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TINF2Q9BSI4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TINF2Q9BSI4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TINF2Q9BSI4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TINF2Q9BSI4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TINF2Q9BSI4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TINF2Q9BSI4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TINF2Q9BSI4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TINF2Q9BSI4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TINF2Q9BSI4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TINF2Q9BSI4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TINF2Q9BSI4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TINF2Q9BSI4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TINF2Q9BSI4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TINF2Q9BSI4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TINF2Q9BSI4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms