Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NIPSNAP3BQ9BS92 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms