Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PMCHL2Q9BQD1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms