Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms