Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NAP1L3Q99457 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms