Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TSNARE1Q96NA8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TSNARE1Q96NA8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms