Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF396Q96N95 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms