Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX3

ZNF48, Zinc finger protein 48, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF48Q96MX3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF48Q96MX3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms