Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms