Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

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Length 541 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM20AQ96MK3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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FAM20AQ96MK3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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FAM20AQ96MK3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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FAM20AQ96MK3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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FAM20AQ96MK3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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FAM20AQ96MK3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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FAM20AQ96MK3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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FAM20AQ96MK3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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FAM20AQ96MK3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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FAM20AQ96MK3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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FAM20AQ96MK3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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FAM20AQ96MK3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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FAM20AQ96MK3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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FAM20AQ96MK3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM20AQ96MK3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
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