Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NBPF4Q96M43 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF4Q96M43 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF4Q96M43 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF4Q96M43 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF4Q96M43 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF4Q96M43 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF4Q96M43 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF4Q96M43 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF4Q96M43 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF4Q96M43 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF4Q96M43 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF4Q96M43 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF4Q96M43 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF4Q96M43 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF4Q96M43 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NBPF4Q96M43 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF4Q96M43 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms