Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms