Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VPS50Q96JG6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms