Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EAF1Q96JC9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms