Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BICD1Q96G01 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BICD1Q96G01 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BICD1Q96G01 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BICD1Q96G01 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BICD1Q96G01 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BICD1Q96G01 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BICD1Q96G01 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BICD1Q96G01 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BICD1Q96G01 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BICD1Q96G01 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BICD1Q96G01 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BICD1Q96G01 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BICD1Q96G01 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BICD1Q96G01 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BICD1Q96G01 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BICD1Q96G01 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BICD1Q96G01 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BICD1Q96G01 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BICD1Q96G01 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BICD1Q96G01 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BICD1Q96G01 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BICD1Q96G01 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
BICD1Q96G01 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BICD1Q96G01 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BICD1Q96G01 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BICD1Q96G01 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BICD1Q96G01 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BICD1Q96G01 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BICD1Q96G01 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BICD1Q96G01 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BICD1Q96G01 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BICD1Q96G01 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BICD1Q96G01 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BICD1Q96G01 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BICD1Q96G01 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BICD1Q96G01 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BICD1Q96G01 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BICD1Q96G01 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BICD1Q96G01 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
BICD1Q96G01 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BICD1Q96G01 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BICD1Q96G01 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BICD1Q96G01 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BICD1Q96G01 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
BICD1Q96G01 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BICD1Q96G01 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BICD1Q96G01 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BICD1Q96G01 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BICD1Q96G01 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BICD1Q96G01 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BICD1Q96G01 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BICD1Q96G01 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BICD1Q96G01 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BICD1Q96G01 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BICD1Q96G01 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BICD1Q96G01 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BICD1Q96G01 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BICD1Q96G01 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BICD1Q96G01 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BICD1Q96G01 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BICD1Q96G01 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BICD1Q96G01 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BICD1Q96G01 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
BICD1Q96G01 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BICD1Q96G01 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BICD1Q96G01 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BICD1Q96G01 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BICD1Q96G01 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BICD1Q96G01 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BICD1Q96G01 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BICD1Q96G01 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BICD1Q96G01 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BICD1Q96G01 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BICD1Q96G01 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BICD1Q96G01 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BICD1Q96G01 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BICD1Q96G01 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BICD1Q96G01 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BICD1Q96G01 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BICD1Q96G01 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BICD1Q96G01 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
BICD1Q96G01 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
BICD1Q96G01 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BICD1Q96G01 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BICD1Q96G01 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BICD1Q96G01 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BICD1Q96G01 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BICD1Q96G01 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BICD1Q96G01 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BICD1Q96G01 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BICD1Q96G01 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BICD1Q96G01 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BICD1Q96G01 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BICD1Q96G01 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BICD1Q96G01 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BICD1Q96G01 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BICD1Q96G01 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BICD1Q96G01 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BICD1Q96G01 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms