Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX11Q96FC9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms