Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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