Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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FAM3DQ96BQ1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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FAM3DQ96BQ1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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FAM3DQ96BQ1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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FAM3DQ96BQ1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM3DQ96BQ1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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