Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EME1Q96AY2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms