Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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TRIM63Q969Q1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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TRIM63Q969Q1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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TRIM63Q969Q1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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TRIM63Q969Q1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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TRIM63Q969Q1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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TRIM63Q969Q1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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TRIM63Q969Q1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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TRIM63Q969Q1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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TRIM63Q969Q1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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TRIM63Q969Q1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRIM63Q969Q1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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