Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms